김독자는 ‘스웨터의 영혼’을 사용해 일시적으로 유령종이 되지만 트라우마가 폭주하고, 제4의 벽의 영향력이 약해진 틈에 예언자 안나 크로프트의 의식과 마주친다. 안나는 거짓 간파로 독자의 정체를 캐묻고 거래 내역을 언급하지만, 제4의 벽이 복구되며 상황이 끝난다. 이후 독자는 동료들과 재회하고 3차 시나리오가 종료됐음을 확인한다.

김독자는 의기소침한 이현성의 특성을 진화시키기 위해 동료들에게 칭찬을 부탁하고, 이현성은 책임감과 자존감을 되찾기 시작한다. 이후 김독자는 이지혜에게 도움을 요청해 유중혁 세력과 공필두 일행의 충돌을 막으려 하며, 자정마다 괴물이 몰려오는 세 번째 메인 시나리오 4일 차가 시작된다.

김독자는 희원·상아에게 길영을 데리고 4호선 플렉스폼으로 이동하라고 지시하고, 현성에게 작전의 핵심 역할을 맡긴다. 공필두의 사유지에서 일행과 무장 침입자들이 충돌하는 가운데 현성의 특성이 진화하고, ‘태산 부수기’로 일대를 무너뜨려 전투의 흐름을 바꾼다. 이후 현성은 김독자와 서로의 이야기를 듣고 싶다고 말한다.

김독자는 동료들에게 충무로의 소규모 방을 파괴하게 하고, 공필두 채널의 성좌들이 자신을 암살하도록 유도한다. 이후 시나리오가 긴급 방어전으로 바뀌어 괴물들이 한꺼번에 나타나자, 김독자는 공필두를 설득해 사람들과 함께 싸우게 하고 공필두는 무장지대를 펼쳐 방어에 나선다.

김독자는 코인이 바닥나 죽어가는 공필두를 살리기 위해 디펜스 마스터와 계약하고, 공필두에게 명령권을 행사해 일행을 지키며 괴물들과 싸우게 한다. 이후 유중혁이 히든 던전에서 위험에 처했다고 판단한 김독자는 그를 구하러 떠난다.

김독자 일행은 극장 던전에 입장해 찢어진 포스터들 사이에서 유일하게 남은 관문을 발견한다. 관문을 통과한 일행은 영화 속 세계로 이동하고, 트라이아스기의 거대 곤충과 괴수종의 습격을 받으며 숨겨진 보상이 있는 히든 던전에 도전한다.

김독자 일행은 역할을 나눠 티라노사우루스 렉스를 공략하고, 이길영의 특수 능력과 동료들의 협력으로 사냥에 성공한다. 일행은 능력치 강화 아이템을 나눠 가진 뒤 다음 층으로 이동하지만, 극장 던전의 최종 목표가 극장 주인을 처치하는 하드 시나리오임을 확인한다.

김독자 일행은 극장 던전의 두 번째 영화를 클리어하고 보상의 방에서 A급 아이템을 얻는다. 이후 유중혁이 남긴 마지막 영화가 상영되자, 일행은 이순신 장군이 없는 명량 해전을 맞닥뜨리며 큰 위기에 처한다.

이지혜는 친구를 직접 죽인 죄책감과 자기혐오에 빠져 싸움을 거부한다. 김독자는 그녀가 살아남아야 다른 사람들도 살릴 수 있다고 설득하고, 이에 반응한 성좌 ‘해상전신’은 이지혜에게 새로운 성흔을 부여한다. 이후 이지혜는 명량 해전에 나서고, 전투가 시작된다.

김독자는 이지혜가 유령 함대를 물리친 뒤 해상제독의 성흔 ‘칼의 노래’를 얻은 것을 확인한다. 일행은 유중혁을 발견하지만, 그는 극장 주인 시뮬레이션에 조종당해 공격하고 김독자·정희원 등이 맞선다. 전투 중 유중혁이 강력한 기술을 사용하며 상황이 급격히 악화된다.

극장 주인에게 조종당한 유중혁을 구하기 위해 정희원과 이길영이 공격을 지원하지만, 유중혁은 강화된 능력과 스킬로 압도한다. 김독자는 회귀로 모든 것을 잊는 유중혁의 절망을 일깨우며 싸울 의지를 되찾게 하고, 유중혁은 김독자를 의심한다.

김독자는 극장 주인 시뮬라시용과 맞서기 위해 전력을 다하고, 성좌 ‘충무공’의 ‘칼의 노래’ 버프를 발동한다. 시뮬라시용의 정신 침식 시도는 ‘제4의 벽’ 덕분에 무사히 넘어가며, 보상으로 코인을 얻고 결계를 해제한다. 이후 세 번째 메인 시나리오가 종료되고, 전 세계에 유성우가 내리며 새로운 위기의 전조가 나타난다.

네 번째 메인 시나리오를 앞두고 김독자는 충무로의 대표가 되기 위해 흰색 깃발을 차지하고, 명령권으로 공필두를 제압한다. 그는 충무로에 남을 사람들에게 자신의 통제를 따르라고 제안하며 세력을 정비하고, 새 시나리오에서 창신역의 깃발 거점을 점거하라는 임무를 받는다.

충무로 그룹은 창신역의 깃발 꽂이를 점거해야 하는 네 번째 시나리오의 규칙과 제한 시간을 확인한다. 동대문 그룹의 부대표 강일훈이 동맹을 제안하지만, 김독자는 정보를 얻기 위해 이를 받아들이는 척한다. 이후 일행은 이동 중 습격을 받고 전투가 벌어지며, 김독자는 유상아를 보호하고 습격자를 제압하려 한다.

명동 대표 김현태의 적색 깃발과 공필두의 스킬이 충돌하고, 전투 끝에 독자는 흰색 깃발을 적색으로 진화시켜 명동역을 점거한다. 독자는 붙잡은 인물에게 충무로 습격 정보를 캐내고 ‘선지자들’의 존재를 확인한 뒤, 명동역 점거를 계기로 ‘왕의 길’ 시나리오를 시작한다.

김독자는 ‘왕의 길’ 히든 시나리오에 따라 제한 시간 내 여러 역을 점거해야 하며, 충무로역을 비운 사이의 방어와 통솔을 위해 유상아를 부대표로 임명한다. 일행은 동대문역사문화공원역을 점거한 뒤 동묘앞역으로 향하고, 그곳에서 역을 차지한 이성국에게 동대문역과 동묘앞역을 넘기라고 요구한다. 이후 새로운 메인 시나리오의 표적 역이 창신역으로 지정된다.