신유승이 재앙의 권리를 완전히 박탈당하자 스타 스트림은 그에게 한 시간 안에 피스 랜드의 지배종을 처치하라는 벌칙을 부여한다. 김독자는 일본 투입자 미치오 쇼지와 만나 소인들을 죽이라는 상반된 전서구의 진상을 조사하기로 하며, 소인을 무조건 제거하는 선택에 의문을 제기한다.

김독자는 신유승과 함께 1차 투입자들의 흔적을 따라 이즈미 히로키 일행을 찾지만, 이즈미의 동료 미치오 쇼지에게서 이즈미가 사라졌고 ‘뱀의 화신’이 근처에 있다는 사실을 알게 된다. 미치오는 김독자를 구해 준 은혜를 갚기 위해 적대 세력에 맞서 시간을 벌고, 김독자는 동료들을 살리기 위해 뱀 사냥 여부를 결정해야 한다.

미치오 쇼지가 김독자 일행을 돕기 위해 자신이 가진 재앙의 권리를 포기하고 시간을 번다. 김독자는 전용 스킬로 일행을 이동시키지만 같은 재앙에 대한 적대 행위로 페널티를 받고, 아스카 렌과 일본 그룹의 보스 아마모토 하지메를 발견한다. 그러나 아마모토는 ‘뱀’이 아니라 만년 묵은 지네의 화신으로 밝혀진다.

만년백각오공의 힘을 얻은 일본의 왕 아마모토 하지메가 일행을 공격하고, 독자는 메인 시나리오에 따라 명망 높은 재앙을 처치해야 하는 상황에 놓인다. 독자는 불살의 왕 효과를 잃지 않기 위해 신중하게 싸우며, 특수 권능으로 모순의 음양사 아베노 세이메이를 불러 전세를 바꾼다. 이후 이복순이 합류해 공격을 준비한다.

이복순은 ‘오공원 두꺼비’를 강신해 지네장터 설화의 상황에서 강력해진 푸른 불로 야마모토 하지메를 처치하고 재앙으로서의 권리를 포기한다. 김독자는 이복순을 데리고 도주하지만, 밤이 된 피스 랜드의 숲이 미로로 변하고 소인종 사냥 제한 시간이 촉박해진다.

김독자는 피스랜드의 소인종을 사냥하려는 세력과 맞서 일행을 베로니카 왕성으로 보내려 한다. 아스카 렌은 동료들을 지키기 위해 남고, 김독자는 시키가미와 성좌의 도움으로 적을 막지만 새로운 시나리오와 ‘뱀 사냥’ 시나리오가 발동된다.

공필두가 ‘무장요새’를 발동해 사유지를 침범한 재앙을 몰아내고, 일행은 무사히 위기를 넘긴다. 김독자는 한수영과 공필두가 피스 랜드에서 소인이 된 경위와 베로니카 왕국을 구한 일을 듣고, 일본 화신 아스카 렌에게 한국 그룹에 합류하라고 제안한다. 이후 소인종 편에 서서 재앙을 처치하는 메인 시나리오가 제시된다.

일행은 소인종의 행성 피스랜드를 공격하는 재앙들을 처치하고 왕성 베로니카를 지키는 시나리오를 수행한다. 김독자는 재앙의 왕이 이즈미 히로키임을 추리하고, 이즈미가 ‘절대 왕좌’의 명령을 거부하며 동료들을 공격하자 그 배후성이 아마타노 오로치임을 알아낸다. 일행은 이즈미를 당장 처치하지 않고 동쪽 지대의 강자를 만나러 향한다.

김독자 일행은 피스랜드를 만든 작가 아스카 렌과 만나고, 렌이 자신의 작품 속 인물들을 죽이려 했다는 사실을 따진다. 김독자는 실패한 작품이라도 자신이 만든 세계와 인물에 책임져야 한다고 설득하고, 렌은 피스랜드를 구하겠다고 결심한다. 이후 피스랜드를 공격하는 재앙들을 처치하라는 메인 시나리오가 발동된다.

김독자는 피스랜드의 최강 귀환자 키리오스 로드그라임을 찾아가 행성을 구할 도움을 요청한다. 키리오스가 피스랜드의 멸망을 받아들이며 떠나라고 하자, 김독자는 성좌들의 위협을 언급하고 재앙을 물리치겠다며 제자로 삼아 달라고 한다. 이후 피스랜드의 재앙을 처치하는 메인 시나리오가 발동한다.

김독자는 키리오스 로드그라임의 제자가 되어 피스 랜드로 돌아가기 전 비전절기를 배우기 시작한다. 혹독한 반복 수련 끝에 백청강기를 익히고, 피스 랜드의 재앙을 처치하는 메인 시나리오와 추가 하든 시나리오를 확인한다.

피스 랜드에서 일행은 다가오는 적의 공격에 대비해 방어 시설 안으로 철수하고 전투를 준비한다. ‘여럿 머리의 군주’가 절대 왕좌로 재앙들을 부르는 가운데, 김독자는 자신이 만든 인물 키리오스가 이야기 밖에서 독립적으로 살아가는 모습을 확인한다. 이후 소인종의 편에 서서 피스 랜드를 공격하는 명망 높은 재앙들을 처치하는 메인 시나리오가 제시된다.

피스 랜드 방어군이 정문을 노린 적들의 공격에 밀리던 중, 미치오 쇼지가 능력을 발동해 반격하고 전세를 잠시 뒤집는다. 그러나 명망 높은 재앙인 재앙의 왕이 모습을 드러내고, 그 배후에서 성좌 ‘여럿 머리의 군주’ 아마타노 오로치의 그림자가 현현한다. 김독자는 당장 싸우기보다 때를 기다리며 일행과 생존자들을 구할 방법을 모색한다.

김독자는 41회차 신유승과의 약속을 지키기 위해, 신유승을 죽이는 개연성에 동의한 성좌들에게 복수하려 한다. 아마타노 오로치와 맞선 그는 토츠카노츠루기의 ‘패배’ 설화를 약점으로 이용하려 하지만, 오로치는 진언까지 사용하며 반격한다. 이후 피스 랜드와 뱀 사냥에 관한 시나리오가 제시된다.

김독자는 유중혁의 공격을 지켜보다가 ‘도깨비 책갈피’를 활성화해 일부 스킬을 사용한다. 그는 세 걸음 안에 적을 죽여야 하는 상황에서 전투에 나서고, 여럿 머리의 군주는 개연성을 모두 소진해 더는 힘을 빌릴 수 없게 된다. 이후 시스템 간섭으로 새로운 메인·하든 시나리오와 피스랜드의 멸망 조건이 제시된다.

누군가 시나리오 시스템에 간섭하는 가운데, 이계의 신격이 행성의 일에 개입한 존재를 경고한다. 이후 ‘재앙의 왕’이 사냥되고 여섯 번째 메인 시나리오가 클리어되며, 주인공은 네 개의 설화를 쌓고 성좌가 되기 위한 마지막 설화를 준비하게 된다.